Le village de Lantilly est situé sur une colline de l’Auxois, à 372 métres au-dessus du niveau de la mer. On y accéde par quatre routes :

• Les Laumes,
• Grignon,
• Champ-d’Oiseau
• Semur.

La commune regroupe le hameau de Cormaillon au pied de la colline en direction des Laumes, et la ferme de Chasselembert, en direction de Semur.

Deux ruisseaux traversent le territoire : le ruisseau de Lantilly prenant sa source à la fontaine Dormont et le ruisseau du Breuil. Près du croisement des routes de Lantilly, Grignon et les Laumes, à la sortie de Carmai lion, ils rencontrent le ruisseau de Vau et finalement leurs eaux se jettent dans le Canal de Bourgogne, prés des Granges-sous-Grignon. Elles sont ensuite emmenées dans la Saône et le Rhône et arrivent enfin dans la mer méditerranée.