En 1852, la Croix-Rousse, qui compte désormais 30 000 habitants, est rattachée à Lyon (décret impérial du 24 mars 1852). Le préfet Vaïsse va alors entreprendre une série de grands travaux (création du réseau d’eau potable, construction de l’Hôpital de la Croix-Rousse, etc).
En 1862, la Croix-Rousse est reliée au centre de Lyon par le premier funiculaire du monde. Il sera rapidement surnommé la "ficelle" par les lyonnais. En 1865, pour faciliter l’intégration de la Croix-Rousse à la ville, les remparts sont détruits, permettant la réalisation du boulevard de l’Empereur. La mairie y est construite, et des arbres sont plantés.

Depuis 1952, la colline est traversée par le tunnel routier de la Croix-Rousse, qui relie les quais des bords du Rhône à ceux des bords de la Saône (tracé de la RN6).

L’activité du textile a été très fortement marquée par une crise dans les années 1980. Les rares survivants se reconvertissent dans des textiles « techniques » ou très haut de gamme (ex : Tassinari, Brochier, Bianchini-Férier).

Aujourd’hui encore, la Croix-Rousse est un quartier à l’urbanisme singulier, marqué à la fois par sa géographie (colline), par son histoire (histoire de la soierie lyonnaise), par la permanence du mouvement social et par sa très forte densité d’habitation.